Mnohé ochorenia však vedú k abnormálnej funkcii koagulačného systému, ako aj k poškodeniu intimy cievy a stáza krvi spôsobí, že fibrinolytický systém príliš oneskorene alebo nedostatočne rozpustí trombus.
Napríklad pri akútnom infarkte myokardu dochádza k trombóze v srdcových cievach. Stav ciev je veľmi zlý, dochádza k rôznym poškodeniam intimy a stenóze, spolu so stagnáciou prietoku krvi, trombus sa nedá rozpustiť a trombus sa bude len zväčšovať a zväčšovať.

Napríklad u ľudí, ktorí sú dlhodobo pripútaní na lôžko, je lokálny prietok krvi v nohách spomalený, intima ciev je poškodená a vzniká trombus. Trombus sa bude ďalej rozpúšťať, ale rýchlosť rozpúšťania nie je dostatočne vysoká, môže odpadnúť, prúdiť späť do pľúcnej tepny pozdĺž krvného systému, uviaznuť v pľúcnej tepne a spôsobiť pľúcnu embóliu, ktorá je tiež smrteľná.
V súčasnosti je potrebné, aby sa zabezpečila bezpečnosť pacientov, umelo vykonávať trombolýzu a injekčne podávať lieky na podporu trombolýzy, ako napríklad „urokináza“. Trombolýza sa však vo všeobecnosti musí vykonať v krátkom čase od vzniku trombózy, napríklad do 6 hodín. Ak trvá dlho, trombóza sa nerozpustí. Ak v tomto čase zvýšite užívanie trombolytických liekov, môže to spôsobiť krvácanie v iných častiach tela.
Trombus sa nedá rozpustiť. Ak nie je úplne zablokovaný, možno použiť „stent“ na „otvorenie“ zablokovanej cievy, aby sa zabezpečil plynulý prietok krvi.

Ak je však cieva dlhodobo blokovaná, spôsobí to ischemickú nekrózu dôležitých tkanivových štruktúr. V tomto čase je možné zaviesť iné cievy, aby sa tento kúsok tkaniva, ktorý stratil zásobenie krvou, „zavlažil“ iba „obíhaním“.

Krvácanie a koagulácia, trombóza a trombolýza, to je krehká rovnováha, ktorá udržiava metabolické aktivity tela. Nielen to, v ľudskom tele existuje mnoho dômyselných rovnováh, ako napríklad sympatický nerv a blúdivý nerv, ktoré udržiavajú dráždivosť ľudí bez nadmerného vzrušenia; inzulín a glukagón regulujú rovnováhu cukru v krvi ľudí; kalcitonín a parathormón regulujú hladinu cukru v krvi ľudí.