Selepas trombosis terbentuk, strukturnya berubah di bawah tindakan sistem fibrinolitik dan kejutan aliran darah serta regenerasi badan.

Terdapat 3 jenis utama perubahan akhir dalam trombus:

1. Melembutkan, melarutkan, menyerap

Selepas trombus terbentuk, fibrin di dalamnya menyerap sejumlah besar plasmin, supaya fibrin dalam trombus menjadi polipeptida larut dan larut, dan trombus menjadi lembut. Pada masa yang sama, kerana neutrofil dalam trombus hancur dan melepaskan enzim proteolitik, trombus juga boleh larut dan dilembutkan.

Trombus kecil itu larut dan cair, dan boleh diserap sepenuhnya atau dihanyutkan oleh aliran darah tanpa meninggalkan sebarang kesan.

Bahagian trombus yang lebih besar dilembutkan dan mudah jatuh oleh aliran darah untuk menjadi embolus. Emboli menyekat saluran darah yang sepadan dengan aliran darah, yang boleh menyebabkan embolisme, manakala bahagian yang selebihnya teratur.

2. Mekanisasi dan Pengkanalisasian Semula

Trombus yang lebih besar tidak mudah larut dan diserap sepenuhnya. Biasanya, dalam masa 2 hingga 3 hari selepas pembentukan trombus, tisu granulasi tumbuh dari intima vaskular yang rosak di mana trombus melekat, dan secara beransur-ansur menggantikan trombus, yang dipanggil organisasi trombus.
Apabila trombus tersusun, trombus mengecut atau sebahagiannya larut, dan rekahan sering terbentuk di dalam trombus atau di antara trombus dan dinding saluran darah, dan permukaannya diliputi oleh sel endotel vaskular yang membiak, dan akhirnya satu atau beberapa saluran darah kecil yang berkomunikasi dengan saluran darah asal terbentuk. Rekanalisasi aliran darah dipanggil rekanalisasi trombus.

3. Pengapuran

Sebilangan kecil trombi yang tidak dapat larut atau tersusun sepenuhnya mungkin dimendakkan dan dikalsifikasikan oleh garam kalsium, membentuk batu keras yang terdapat di dalam saluran darah, yang dipanggil flebolith atau arteriolit.