עם זאת, מחלות רבות יובילו לתפקוד לקוי של מערכת הקרישה, כמו גם נזק לאינטימה של כלי הדם, וקיפאון דם יגרום למערכת הפיברינוליטית להגיע מאוחר מדי או לא מספיק כדי להמיס את הפקקת.
לדוגמה, באוטם שריר הלב חריף, ישנה פקקת בכלי הדם של הלב. מצב כלי הדם גרוע מאוד, ישנן פגיעות שונות באינטימה, וישנה היצרות, יחד עם קיפאון של זרימת הדם, אין דרך להמיס את הפקקת, והפקקת רק תגדל ותגדל.

לדוגמה, אצל אנשים המרותקים למיטה זמן רב, זרימת הדם המקומית ברגליים איטית, האינטימה של כלי הדם נפגעת, ונוצר פקקת. הפקקת תמשיך להתמוסס, אך מהירות ההמסה אינה מהירה מספיק, היא עלולה ליפול, לזרום חזרה לעורק הריאה לאורך מערכת הדם, להיתקע בעורק הריאה ולגרום לתסחיף ריאתי, שהוא גם קטלני.
בשלב זה, על מנת להבטיח את בטיחות המטופלים, יש צורך לבצע טרומבוליזה מלאכותית ולהזריק תרופות המשמשות לקידום טרומבוליזה, כגון "אורוקינאז". עם זאת, טרומבוליזה בדרך כלל צריכה להתבצע תוך זמן קצר מרגע הפקקת, כגון תוך 6 שעות. אם זה לוקח זמן רב, היא לא תתמוסס. אם תגדילו את השימוש בתרופות טרומבוליטיות בשלב זה, הדבר עלול לגרום לדימום בחלקים אחרים של הגוף.
לא ניתן להמיס את הפקקת. אם היא אינה חסומה לחלוטין, ניתן להשתמש ב"סטנט" כדי "למשוך" את כלי הדם החסום כדי להבטיח זרימת דם חלקה.

עם זאת, אם כלי הדם חסום למשך זמן רב, הדבר יגרום לנמק איסכמי של מבני רקמה חשובים. בשלב זה, רק על ידי "עקיפה" ניתן להכניס כלי דם אחרים כדי "להשקות" את פיסת הרקמה הזו שאיבדה את אספקת הדם שלה.

דימום וקרישה, טרומבוז ותרומבוליזה, זהו האיזון העדין ששומר על הפעילות המטבולית של הגוף. לא רק זאת, ישנם איזונים גאוניים רבים בגוף האדם, כמו העצב הסימפתטי ועצב הוואגוס, אשר שומרים על עירור של אנשים מבלי להיות מעוררים יתר על המידה; אינסולין וגלוקגון מווסתים את מאזן הסוכר בדם של אנשים; קלציטונין והורמון פאראתירואיד מווסתים את רמת הסוכר בדם של אנשים.