После образования тромба его структура изменяется под действием фибринолитической системы, кровотока и регенерации организма.

В тромбе можно выделить 3 основных типа конечных изменений:

1. Размягчить, растворить, впитать

После образования тромба содержащийся в нем фибрин поглощает большое количество плазмина, в результате чего фибрин в тромбе превращается в растворимый полипептид и растворяется, а тромб размягчается. Одновременно с этим, поскольку нейтрофилы в тромбе распадаются и выделяют протеолитические ферменты, тромб также растворяется и размягчается.

Небольшой тромб растворяется и разжижается, после чего может быть полностью поглощен или выведен из кровотока, не оставляя следов.

Большая часть тромба размягчается и легко отпадает под действием кровотока, образуя эмбол. Эмболы блокируют соответствующий кровеносный сосуд, что может привести к эмболии, в то время как оставшаяся часть организуется.

2. Механизация и реканализация

Более крупные тромбы трудно растворить и полностью рассосать. Обычно в течение 2-3 дней после образования тромба из поврежденной сосудистой интимы в месте прикрепления тромба разрастается грануляционная ткань, которая постепенно замещает тромб; этот процесс называется организацией тромба.
Когда тромб организуется, он уменьшается в размерах или частично растворяется, внутри тромба или между тромбом и стенкой сосуда часто образуется трещина, поверхность которой покрывается пролиферирующими эндотелиальными клетками сосудов, и, наконец, образуются один или несколько мелких кровеносных сосудов, сообщающихся с исходным кровеносным сосудом. Реканализация кровотока называется реканализацией тромба.

3. Кальцификация

Небольшое количество тромбов, которые не могут быть полностью растворены или организованы, могут осаждаться и кальцифицироваться солями кальция, образуя твердые камни, находящиеся в кровеносных сосудах, называемые флеболитами или артериолитами.