Susiformavus trombozei, jos struktūra keičiasi veikiant fibrinolizinei sistemai ir kraujotakos šokui bei organizmo regeneracijai.

Yra 3 pagrindiniai trombo galutinių pokyčių tipai:

1. Suminkštinti, ištirpinti, sugerti

Susidarius trombui, jame esantis fibrinas absorbuoja didelį kiekį plazmino, todėl trombe esantis fibrinas tampa tirpiu polipeptidu ir ištirpsta, o trombas suminkštėja. Tuo pačiu metu, kadangi trombe esantys neutrofilai suyra ir išskiria proteolitinius fermentus, trombas taip pat gali ištirpti ir suminkštėti.

Mažas trombas ištirpsta ir suskystėja, jį gali visiškai absorbuoti arba išplauti kraujas nepalikdamas pėdsakų.

Didžioji trombo dalis suminkštėja ir lengvai atkrenta dėl kraujo tekėjimo, sudarydama embolą. Embolas užkemša atitinkamą kraujagyslę kraujo tekėjimu, o tai gali sukelti emboliją, o likusi dalis sutvarkoma.

2. Mechanizavimas ir rekanalizacija

Didesnius trombus sunku ištirpinti ir visiškai absorbuoti. Paprastai per 2–3 dienas po trombo susidarymo iš pažeisto kraujagyslės intimos, kur prisitvirtinęs trombas, išauga granuliacinis audinys ir palaipsniui pakeičia trombą, tai vadinama trombo organizacija.
Trombui susiorganizavus, jis susitraukia arba iš dalies ištirpsta, dažnai trombo viduje arba tarp trombo ir kraujagyslės sienelės susidaro plyšys, kurio paviršių padengia proliferuojančios kraujagyslių endotelio ląstelės ir galiausiai susidaro viena ar kelios mažos kraujagyslės, susisiekiančios su pradine kraujagysle. Kraujo tėkmės rekanalizacija vadinama trombo rekanalizacija.

3. Kalcifikacija

Nedidelis kiekis trombų, kurių negalima visiškai ištirpinti ar sutvarkyti, gali būti nusodinti ir kalcifikuoti kalcio druskomis, sudarydami kraujagyslėse esančius kietus akmenis, vadinamus flebolitais arba arteriolitais.