Թրոմբոզի ձևավորումից հետո դրա կառուցվածքը փոխվում է ֆիբրինոլիտիկ համակարգի և արյան հոսքի ցնցման և մարմնի վերականգնման ազդեցության տակ։

Թրոմբում կան վերջնական փոփոխությունների 3 հիմնական տեսակ՝

1. Մեղմացնել, լուծել, կլանել

Թրոմբի առաջացումից հետո դրա մեջ պարունակվող ֆիբրինը կլանում է մեծ քանակությամբ պլազմին, որի պատճառով թրոմբում գտնվող ֆիբրինը դառնում է լուծելի պոլիպեպտիդ և լուծվում, իսկ թրոմբը փափկում է: Միևնույն ժամանակ, քանի որ թրոմբում գտնվող նեյտրոֆիլները քայքայվում և արտազատում են պրոտեոլիտիկ ֆերմենտներ, թրոմբը նույնպես կարող է լուծվել և փափկել:

Փոքրիկ թրոմբը լուծվում և հեղուկանում է, և կարող է ամբողջությամբ կլանվել կամ լվացվել արյան հոսքով՝ առանց հետք թողնելու։

Թրոմբի մեծ մասը փափկացնում է և հեշտությամբ պոկվում արյան հոսքի միջոցով՝ դառնալով էմբոլ։ Էմբոլները արյան հոսքով խցանում են համապատասխան արյան անոթը, ինչը կարող է առաջացնել էմբոլիա, մինչդեռ մնացած մասը կազմակերպվում է։

2. Մեքենացում և վերամատակարարում

Ավելի մեծ թրոմբները հեշտությամբ չեն լուծվում և լիովին չեն ներծծվում: Սովորաբար, թրոմբի առաջացումից հետո 2-3 օրվա ընթացքում վնասված անոթային ինտիմայից, որտեղ ամրացված է թրոմբը, աճում է գրանուլյացիոն հյուսվածք և աստիճանաբար փոխարինում է թրոմբին, ինչը կոչվում է թրոմբի կազմակերպում:
Երբ թրոմբը կազմակերպվում է, թրոմբը կծկվում կամ մասամբ լուծվում է, և թրոմբի ներսում կամ թրոմբի և անոթի պատի միջև հաճախ առաջանում է ճեղք, և մակերեսը ծածկվում է բազմացող անոթային էնդոթելային բջիջներով, և վերջապես առաջանում են մեկ կամ մի քանի փոքր արյան անոթներ, որոնք շփվում են սկզբնական արյան անոթի հետ։ Արյան հոսքի վերականալիզացիան կոչվում է թրոմբի վերականալիզացիա։

3. Կալցինացիա

Փոքր քանակությամբ թրոմբներ, որոնք չեն կարող լիովին լուծվել կամ կազմակերպվել, կարող են նստվածք ստանալ և կալցիումականացվել կալցիումի աղերի ազդեցությամբ՝ առաջացնելով արյան անոթներում գոյություն ունեցող կարծր քարեր, որոնք կոչվում են ֆլեբոլիտներ կամ զարկերակոլիտներ։