Despois de que se forme a trombose, a súa estrutura cambia baixo a acción do sistema fibrinolítico, o choque do fluxo sanguíneo e a rexeneración do corpo.

Hai 3 tipos principais de cambios finais nun trombo:

1. Abrandar, disolver, absorber

Despois de que se forme o trombo, a fibrina que contén absorbe unha gran cantidade de plasmina, de xeito que a fibrina do trombo se converte nun polipéptido soluble e se disolve, e o trombo se abranda. Ao mesmo tempo, debido a que os neutrófilos do trombo se desintegran e liberan encimas proteolíticos, o trombo tamén se pode disolver e abrandar.

O pequeno trombo disólvese e licúase, e pode ser completamente absorbido ou lavado pola corrente sanguínea sen deixar rastro.

A parte maior do trombo abrandase e despréndese facilmente co fluxo sanguíneo para converterse nun émbolo. Os émbolos bloquean o vaso sanguíneo correspondente co fluxo sanguíneo, o que pode causar embolia, mentres que a parte restante se organiza.

2. Mecanización e Recanalización

Os trombos máis grandes non son fáciles de disolver e absorber completamente. Normalmente, nun prazo de 2 a 3 días despois da formación do trombo, o tecido de granulación medra a partir da íntima vascular danada onde se adhire o trombo e, gradualmente, o substitúe, o que se denomina organización do trombo.
Cando o trombo se organiza, este contrae ou disólvese parcialmente e adoita formarse unha fisura dentro do trombo ou entre o trombo e a parede do vaso, e a superficie cóbrese por células endoteliais vasculares proliferantes e, finalmente, fórmanse un ou varios vasos sanguíneos pequenos que se comunican co vaso sanguíneo orixinal. A recanalización do fluxo sanguíneo chámase recanalización do trombo.

3. Calcificación

Un pequeno número de trombos que non se poden disolver ou organizar completamente poden precipitarse e calcificarse por sales de calcio, formando cálculos duros existentes nos vasos sanguíneos, chamados flebolitos ou arteriolitos.