Tromboosin muodostumisen jälkeen sen rakenne muuttuu fibrinolyyttisen järjestelmän ja verenkiertoshokin sekä kehon uudistumisen vaikutuksesta.

Trombissa on kolme päätyyppiä lopullisia muutoksia:

1. Pehmentää, liuottaa, imee

Trombin muodostumisen jälkeen sen sisältämä fibriini imee itseensä suuren määrän plasmiinia, jolloin trombin fibriinistä tulee liukoinen polypeptidi ja se liukenee, ja trombi pehmenee. Samanaikaisesti, koska trombin neutrofiilit hajoavat ja vapauttavat proteolyyttisiä entsyymejä, myös trombi voi liueta ja pehmentyä.

Pieni trombi liukenee ja nesteytyy, ja se voi imeytyä kokonaan tai huuhtoutua pois verenkiertoon jättämättä jälkiä.

Trombin suurempi osa pehmenee ja irtoaa helposti verenkierron mukana muodostaen emboluksen. Emboli tukkii vastaavan verisuonen verenkierrolla, mikä voi aiheuttaa embolian, kun taas loput osat järjestäytyvät.

2. Mekanisointi ja uudelleenkanalointi

Suurempia trombeja ei ole helppo liuottaa ja imeä kokonaan. Yleensä 2–3 päivän kuluessa trombin muodostumisesta granulaatiokudos kasvaa vaurioituneesta verisuonten intimasta, johon trombi on kiinnittynyt, ja korvaa trombin vähitellen, tätä kutsutaan trombin organisoitumiseksi.
Kun trombi on järjestäytynyt, se kutistuu tai liukenee osittain, ja trombin sisään tai trombin ja verisuonen seinämän väliin muodostuu usein halkeama, jonka pintaa peittävät lisääntyvät verisuonten endoteelisolut, ja lopulta muodostuu yksi tai useampi pieni verisuoni, jotka ovat yhteydessä alkuperäiseen verisuoneen. Verenkierron uudelleenkanalisaatiota kutsutaan trombin uudelleenkanalisaatioksi.

3. Kalkkiutuminen

Pieni määrä trombeja, joita ei voida täysin liuottaa tai järjestää, voi saostua ja kalkkeutua kalsiumsuolojen vaikutuksesta, jolloin verisuonissa muodostuu kovia kiviä, joita kutsutaan fleboliiteiksi tai arterioliiteiksi.