След образуването на тромбоза, нейната структура се променя под действието на фибринолитичната система и шок от кръвния поток и регенерация на организма.

Има 3 основни вида крайни промени в тромба:

1. Омекотява, разтваря, абсорбира

След образуването на тромба, фибринът в него абсорбира голямо количество плазмин, така че фибринът в тромба се превръща в разтворим полипептид и се разтваря, а тромбът омеква. В същото време, тъй като неутрофилите в тромба се разпадат и освобождават протеолитични ензими, тромбът също може да се разтвори и омекне.

Малкият тромб се разтваря и втечнява и може да бъде напълно абсорбиран или отмит от кръвния поток, без да остави следа.

По-голямата част от тромба се омекотява и лесно пада от кръвния поток, превръщайки се в ембол. Емболите блокират съответния кръвоносен съд с кръвния поток, което може да причини емболия, докато останалата част се организира.

2. Механизация и реканализация

По-големите тромби не се разтварят лесно и не се абсорбират напълно. Обикновено, в рамките на 2 до 3 дни след образуването на тромба, гранулационна тъкан расте от увредената съдова интима, където е прикрепен тромбът, и постепенно го замества, което се нарича тромбна организация.
Когато тромбът се организира, той се свива или частично се разтваря и често се образува фисура вътре в тромба или между тромба и стената на съда, а повърхността се покрива от пролифериращи съдови ендотелни клетки и накрая се образуват един или няколко малки кръвоносни съда, които комуникират с оригиналния кръвоносен съд. Реканализацията на кръвния поток се нарича реканализация на тромба.

3. Калцификация

Малък брой тромби, които не могат да бъдат напълно разтворени или организирани, могат да се утаят и калцифицират от калциеви соли, образувайки твърди камъни в кръвоносните съдове, наречени флеболити или артериолити.