วิธีการกำจัดลิ่มเลือดมีหลายวิธี ได้แก่ การใช้ยาละลายลิ่มเลือด การรักษาโดยวิธีแทรกแซง การผ่าตัด และวิธีการอื่นๆ แนะนำให้ผู้ป่วยเลือกวิธีการกำจัดลิ่มเลือดที่เหมาะสมกับสภาพของตนเองภายใต้คำแนะนำของแพทย์ เพื่อให้ได้ผลการรักษาที่ดีที่สุด

1. การให้ยาละลายลิ่มเลือด: ไม่ว่าจะเป็นลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดดำหรือหลอดเลือดแดง ก็สามารถใช้ยาละลายลิ่มเลือดในการรักษาได้ อย่างไรก็ตาม มีข้อกำหนดบางประการเกี่ยวกับระยะเวลาในการให้ยาละลายลิ่มเลือด ซึ่งต้องทำในระยะเริ่มต้นของการเกิดลิ่มเลือด โดยทั่วไปแล้ว ลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดแดงต้องทำภายใน 6 ชั่วโมงหลังเริ่มมีอาการ และยิ่งเร็วเท่าไหร่ยิ่งดี ส่วนลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดดำต้องทำภายใน 1-2 สัปดาห์หลังเริ่มมีอาการ สามารถเลือกใช้ยาละลายลิ่มเลือด เช่น ยูโรคิเนส สเตรปโตไคเนสแบบรีคอมบิแนนท์ และอัลเทพลาเซสำหรับฉีด ในการรักษาด้วยยาละลายลิ่มเลือด และผู้ป่วยบางรายสามารถละลายลิ่มเลือดและเปิดทางเดินเลือดใหม่ได้ด้วยการใช้ยาละลายลิ่มเลือด

2. การรักษาด้วยการแทรกแซง: ในกรณีของภาวะหลอดเลือดแดงอุดตัน เช่น หลอดเลือดหัวใจอุดตัน หลอดเลือดสมองอุดตัน เป็นต้น สามารถใช้การใส่ขดลวดเพื่อเปิดทางเดินของหลอดเลือด ปรับปรุงการไหลเวียนของเลือดไปยังเนื้อเยื่อหัวใจและสมอง และลดขอบเขตของเนื้อเยื่อหัวใจและสมองที่ตายได้ หากเป็นภาวะหลอดเลือดดำอุดตัน เช่น หลอดเลือดดำส่วนลึกของขา สามารถใส่ตัวกรองหลอดเลือดดำได้ การใส่ตัวกรองโดยทั่วไปจะช่วยป้องกันภาวะแทรกซ้อนจากการหลุดของลิ่มเลือดอุดตันในปอดเท่านั้น และไม่สามารถกำจัดลิ่มเลือดได้อย่างสมบูรณ์ ลิ่มเลือดในหลอดเลือดดำส่วนหลังอาจยังคงอยู่

3. การรักษาด้วยการผ่าตัด: วิธีนี้ส่วนใหญ่ใช้ในการรักษาภาวะลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดแดงส่วนปลาย เช่น ลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดแดงที่ขา ลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดแดงที่คอ เป็นต้น เมื่อเกิดลิ่มเลือดอุดตันในหลอดเลือดขนาดใหญ่ส่วนปลายเหล่านี้ การผ่าตัดเอาลิ่มเลือดออก (thrombectomy) สามารถใช้เพื่อเอาลิ่มเลือดออกจากหลอดเลือดแดง บรรเทาการอุดตันของหลอดเลือด และฟื้นฟูการไหลเวียนของเลือดไปยังเนื้อเยื่อ ซึ่งเป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพในการกำจัดลิ่มเลือดเช่นกัน