Thrombin ist eine weiße bis grauweiße, nichtkristalline Substanz, üblicherweise ein gefriergetrocknetes Pulver.

Thrombin wird auch Gerinnungsfaktor II genannt und ist ein multifunktioneller Gerinnungsfaktor. Seine Hauptfunktion besteht in der Spaltung von Fibrin, wobei jedes primäre Fibrin-Tetraeder vier kleine Peptidfragmente abspaltet. Der verbleibende Teil ist ein Fibrinprotein-Monomer. Diese Monomere verknäueln sich zu einem lockeren, löslichen Netzwerk. Unter dem Einfluss von Gerinnungsfaktor-Ionen und Calciumionen aggregieren die Fibrinmonomere zu einem unlöslichen, vernetzten Fibrinpolymer-Gerinnsel.

Thrombin ist der wichtigste Gerinnungsfaktor im menschlichen Blutgerinnungsprozess. Seine Hauptfunktion besteht darin, das körpereigene Fibrinogen zu aktivieren und Fibrin in aktives Fibrin umzuwandeln, das eine schnelle Blutgerinnung bewirkt. Gleichzeitig kann die Koagulinase durch negative Rückkopplung sowohl die intrinsische als auch die exogene Blutgerinnung beschleunigen und spielt somit eine wichtige Rolle im Blutgerinnungsprozess. Koagulinase ist ein gebräuchliches Hämostyptikum, das häufig in der klinischen Praxis eingesetzt wird. Es eignet sich vor allem zur Behandlung von Blutungen im Verdauungssystem, nach Operationen und bei gynäkologischen Blutungen. Die Anwendung unterliegt strengen Indikationen und muss unter ärztlicher Aufsicht erfolgen.