ניתן לחלק את הפקקת לפקקת מוחית, פקקת ורידים עמוקה בגפיים התחתונות, פקקת עורק ריאתי, פקקת עורקים כליליים וכו' בהתאם למיקום. פקקת שנוצרת במקומות שונים יכולה לגרום לתסמינים קליניים שונים.

1. פקקת מוחית: התסמינים משתנים בהתאם לעורק המעורב. לדוגמה, אם מערכת עורק התרדמה הפנימית מעורבת, חולים סובלים לעיתים קרובות מהימפלגיה, עיוורון בעין הפגועה, נמנום ותסמינים נפשיים אחרים. הם עשויים לסבול מדרגות שונות של אפזיה, אגנוזיה ואפילו תסמונת הורנר, כלומר, מיוזה, אנופתלמוס ואנהידרוזיס בצד הפגוע של המצח. כאשר עורק הוורטברובזילר מעורב, עלולים להופיע סחרחורת, ניסטגמוס, אטקסיה ואפילו חום גבוה, תרדמת ואישונים מדויקים;

2. טרומבוז ורידים עמוקים של הגפיים התחתונות: תסמינים שכיחים כוללים נפיחות ורגישות בגפיים התחתונות. בשלב החריף, העור הופך לאדום, חם ונפוח בצורה חמורה. העור הופך לסגול והטמפרטורה יורדת. המטופל עלול לסבול מפגיעה בניידות, צליעה או כאבים עזים. חוסר יכולת ללכת;

3. תסחיף ריאתי: חולים עשויים לחוות תסמינים כגון קוצר נשימה, כאבים בחזה, שטף דם, שיעול, דפיקות לב, עילפון וכו'. תסמינים אצל קשישים עשויים להיות לא טיפוסיים וללא ביטויים ספציפיים בולטים;

4. טרומבוז בעורקים הכליליים: עקב דרגות שונות של איסכמיה של שריר הלב, גם הביטויים אינם עקביים. תסמינים נפוצים כוללים כאב רטרוסטרנלי הנגרם מהידוק או סחיטה, כלומר, תעוקת חזה. כמו כן, עלולים להופיע קוצר נשימה, דפיקות לב, לחץ בחזה וכו', ולעיתים אף תחושה של מוות מתקרב. הכאב יכול להקרין לכתפיים, לגב ולזרועות, וחלק מהמטופלים אף עשויים להציג תסמינים לא טיפוסיים כמו כאב שיניים.